医疗净化工程主要净化在以下几个方面：

1.手术室的无尘净化空间，病人在手术室经历手术的过程中，是身体为虚弱的时候，很容易感染周围的病毒，给病人造成二次伤害，而医疗净化工程的应用解决了这一问题，医疗净化工程严格控制手术室的温度，气压，气流，保持手术室内的湿度以及室内的洁净度，有效地防止了室外病毒的入侵。

2.医疗净化工程在产房净化空调系统的应用方面也是非常重要的，结合当地全年的气候特点，考虑到手术部及产房存在通过外围护结构的传热，夏季需要供冷、冬季需要供热，因此根据不同功能用房的冷热负荷的特点，需要对医院手术部及产房的净化空调系统进行划分。并且根据当地夏季平均高相对湿度只有20.8%的特点，夏季空调系统不存在降温除湿的可能，因此手术部及产房的净化空调系统采用一次回风方式的空气净化系统即可。

3.除此之外医疗净化工程还作用在无菌室，净化间，ICU病房，在无菌室中只要储存了一些医用疫苗，这些疫苗很容易受到感染，因此需要一个完美的无尘洁净环境，医疗净化工程正好可以保持无菌室的洁净，控制温度湿度，让无菌室始终保持很稳环境。